医学世家．弃儒从医 　　李时珍（林文龙饰）三代行医，自少对医药耳濡目染，著迷於草药研究，但为遵父命投考科举，结果三次落第，遂决心弃儒从医。 　　时珍以服务百姓为主，对穷人赠医施药，甚得人心。他拜奇医小地藏为师，发明了「蒸气消毒化」、「冷敷法」、「疯狗症疗法」等等，闯出名堂，奠定他日后成为药王的基础。 　　温疫期间，官方药局执错药、奸商卖假药的事件层出不穷，时珍遂立志重修历代本草，让世人以辨真伪。 　　权贵打压．逃亡隐世 　　行医成名的时珍，进入太医院。在此期间，他得以博览藏书，丰富了他修订本草的资料。他又接触到针灸铜人，得以深入研究奇经八脉，并发表「脑为元神之府」学说。 　　时珍欲向皇上自廌重修本草，把药医纳入正途。可是，他因力谏丹毒之害，受到权臣严嵩（罗乐林饰）打压。严嵩不惜罗织罪名，欲毁时珍手稿。于是，时珍逃离太医院，展开逃亡生涯。 　　隐世行医．撰写巨著 　　逃亡中，时珍一边隐世行医，一边采集研究草药，决以毕生之力完成《本草纲目》。被通缉期间，他仍冒险四出行医救人，为了医治重创病人，更用曼陀罗花成功研制成全身麻醉药。 　　不幸，时珍最后被捕下狱。严嵩利诱之，要他交出《本草纲目》手稿，便可免死罪，时珍如何决择？ 　　红颜知己．错配鸳鸯 　　在时珍生命中，有两个重要的女人，一个是婚配之妻吴慕榕（李诗韵饰），一个是红颜知己冬青（叶璇饰）。 　　冬青懂得医药，跟时珍在医药救人经历中惺惺相惜而产生情愫。不料兄长果珍（艾威饰）亦喜欢冬青，时珍兄弟情深，于是让爱，并依婚约娶了慕榕为妻。 　　时珍成亲后，才发现冬青所爱之人是自己，已恨错难返，一个是婚配之妻，一个是红颜知己，时珍在情义之间陷於两难，他如何自处？

李言闻是鄿州濒湖的名医，他有感民间医生的社会地位低微，故希望二子李时珍能考取功名，出人头地。珍受父的影响，沉迷草药研究，即使在备考期间仍替病人诊症。珍邂逅假装‘药仙’来赠医施药的冬青，欣赏她的侠义心肠。闻为守故友承诺，要珍在高中科举后迎娶荆王的外甥女吴慕榕。荆王却嫌弃李家社会地位卑微，对他们存有偏见。榕仰慕珍的才华，期待早日下嫁他。寡妇刘一姐因难产而气绝休克，家人误以为她已死，将下葬。岂料下葬时胎儿作动，棺木中流出血水，幸珍与青及时发现将她救出。姐顺利产子，视珍及青为恩人。珍的抱负是行医，对科举考试不感兴趣，无奈在闻的再三施压下不得不答应到武昌赴考。